胞核/胞漿蛋白分離提取實(shí)驗(yàn)小貼士(一)
實(shí)驗(yàn)原理
利用低濃度去垢劑選擇性裂解細(xì)胞膜,同時(shí)保持核膜完整,然后通過(guò)差速離心進(jìn)行分離。
1.選擇性裂解:
使用含有低濃度非離子去垢劑的等滲緩沖液。這種濃度足以溶解細(xì)胞膜和胞漿膜結(jié)構(gòu),但無(wú)法破壞結(jié)構(gòu)更堅(jiān)固的核膜。
2.差速離心:
通過(guò)控制離心力,可以初步將細(xì)胞核(沉淀)與胞漿成分(上清)分離開(kāi)。
1)低速離心:完整的細(xì)胞核是細(xì)胞中最大最重的細(xì)胞器,在較低轉(zhuǎn)速下(500-1,000g)即可沉淀。
2)高速離心:胞漿蛋白、細(xì)胞器(線(xiàn)粒體、微粒體等)需要更高的轉(zhuǎn)速(10,000g以上)才能沉淀。

操作步驟
第一步:細(xì)胞收集與洗滌:
1)吸棄培養(yǎng)皿中的培養(yǎng)基;
2)用預(yù)冷的PBS輕柔地洗滌細(xì)胞2次,充分洗去殘留的血清(血清中含蛋白酶);
3)充分吸盡PBS。
Tip:使用胰酶處理貼壁細(xì)胞時(shí)要嚴(yán)格注意消化時(shí)間;胰酶會(huì)使細(xì)胞變得很脆弱,影響后續(xù)核質(zhì)分離;不同細(xì)胞種類(lèi)其核質(zhì)分離結(jié)果略有所不同。


圖片中左側(cè)為細(xì)胞數(shù)量是2×106個(gè)數(shù)的CHO-S細(xì)胞(黃色細(xì)胞沉淀);圖片右側(cè)為細(xì)胞數(shù)量1×105個(gè)數(shù)的Raw(白色細(xì)胞沉淀),作為反面對(duì)照,細(xì)胞個(gè)頭較小,數(shù)量太少,對(duì)后續(xù)提出的蛋白濃度以及核漿分離結(jié)果有較大的影響。
第二步:細(xì)胞裂解:
1)加入一定量的裂解液裂解細(xì)胞;
2)渦旋振蕩10-15秒(或劇烈吹打),以充分裂解細(xì)胞。此時(shí)應(yīng)觀察到液體變得非常粘稠(因DNA釋放);
3)冰上孵育10-15分鐘。此時(shí),細(xì)胞會(huì)因裂解而變得粘稠,透亮。
Tip:2×106個(gè)細(xì)胞體積通常為20μL,需要使用細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)密度后,再取2×106個(gè)細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

第三步:離心分離:
1)在4°C, 1000g離心5-10分鐘;
2)離心后,溶液分為兩層:
A.上面一層是上清(Supernatant):即為胞漿蛋白提取物;小心將其轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的預(yù)冷離心管中,二次離心,確保細(xì)胞漿蛋白的干凈無(wú)污染。
B.下面的沉淀(Pellet):包含完整的細(xì)胞核以及未破碎的完整細(xì)胞、細(xì)胞骨架等,等待后續(xù)細(xì)胞核蛋白的裂解。


第四步:洗滌細(xì)胞核(關(guān)鍵純化步驟):
1)向沉淀中加入適量預(yù)冷的細(xì)胞漿裂解緩沖液;用移液器非常輕柔地重懸沉淀;
2)再次在4°C,1000 g離心5分鐘;
3)小心吸棄上清;此時(shí)得到的沉淀是較純的細(xì)胞核。
Tip:吸頭切勿觸及細(xì)胞沉淀,為降低胞漿組分對(duì)細(xì)胞核組分的污染,可以在沉淀上方保留極小體積的上清,換用10 μL的吸頭盡可能吸盡,必要時(shí)可將極小體積上清棄掉。

第五步:核蛋白提取
1)向洗凈的細(xì)胞核沉淀中加入適量的預(yù)冷細(xì)胞核裂解緩沖液;
2)在4°C下,通過(guò)渦旋或輕柔吹打重懸沉淀,并在搖床上孵育40分鐘,使核膜裂解,核蛋白充分釋放;
3)在4°C 13000g 離心10分鐘。小心吸取上清,即為核蛋白提取物;將胞漿蛋白和核蛋白分裝后,于-80°C保存。
Tip:為保證提取的核蛋白干凈無(wú)污染,吸取時(shí),可以在沉淀上方棄掉小部分上清。

提取蛋白時(shí),出現(xiàn)的相關(guān)問(wèn)題
1、核質(zhì)分離不充分,出現(xiàn)交叉污染:

2、核蛋白提取效率低:

3、其他問(wèn)題:

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